深圳居民張先生2017年1月23日出售2014年10月購買的非普通住房，屬于個人購買2年以上（含2年）的非普通住房對外銷售的，應以銷售收入減去購買住房價款后的差額按照5%的征收率繳納增值稅。因發票遺失，根據國家稅務總局公告2016年第73號規定向稅務機關提供其他能證明契稅計稅金額的完稅憑證等資料，進行差額扣除。即應交增值稅=（200-140）/（1+5%）*5%=2.86萬元。
一、個人轉讓滿2兩年的住房應按規定繳納增值稅
根據《財政部、國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅〔2016〕36號）《附件3： 營業稅改征增值稅試點過渡政策的規定》第五條規定，個人將購買不足2年的住房對外銷售的，按照5%的征收率全額繳納增值稅；個人將購買2年以上（含2年）的住房對外銷售的，免征增值稅。注：上述政策適用于北京市、上海市、廣州市和深圳市之外的地區。
個人將購買不足2年的住房對外銷售的，按照5%的征收率全額繳納增值稅；個人將購買2年以上（含2年）的非普通住房對外銷售的，以銷售收入減去購買住房價款后的差額按照5%的征收率繳納增值稅；個人將購買2年以上（含2年）的普通住房對外銷售的，免征增值稅。注：上述政策僅適用于北京市、上海市、廣州市和深圳市。
根據《國家稅務總局關于發布<納稅人轉讓不動產增值稅征收管理暫行辦法>的公告》（國家稅務總局公告2016年第14號），第五條規定，個人轉讓其購買的住房，按照以下規定繳納增值稅：
（一）個人轉讓其購買的住房，按照有關規定全額繳納增值稅的，以取得的全部價款和價外費用為銷售額，按照5%的征收率計算應納稅額。
（二）個人轉讓其購買的住房，按照有關規定差額繳納增值稅的，以取得的全部價款和價外費用扣除購買住房價款后的余額為銷售額，按照5%的征收率計算應納稅額。
個體工商戶應按照本條規定的計稅方法向住房所在地主管地稅機關預繳稅款，向機構所在地主管國稅機關申報納稅；其他個人應按照本條規定的計稅方法向住房所在地主管地稅機關申報納稅。
根據上述規定，北京市、上海市、廣州市和深圳市個人對外出售購買滿2年的非普通住房，以銷售收入減去購買住房價款后的差額按照5%的征收率繳納增值稅。
二、個人出售滿2年的非普通住房發票遺失可由其他能證明契稅計稅金額的完稅憑證進行差額扣除申報納稅
根據《國家稅務總局關于納稅人轉讓不動產繳納增值稅差額扣除有關問題的公告》規定：
一、納稅人轉讓不動產，按照有關規定差額繳納增值稅的，如因丟失等原因無法提供取得不動產時的發票，可向稅務機關提供其他能證明契稅計稅金額的完稅憑證等資料，進行差額扣除。
二、納稅人以契稅計稅金額進行差額扣除的，按照下列公式計算增值稅應納稅額：
（一）2016年4月30日及以前繳納契稅的增值稅應納稅額=［全部交易價格（含增值稅）-契稅計稅金額（含營業稅）］÷（1+5%）×5%
（二）2016年5月1日及以后繳納契稅的增值稅應納稅額=［全部交易價格（含增值稅）÷（1+5%）-契稅計稅金額（不含增值稅）］×5%
三、納稅人同時保留取得不動產時的發票和其他能證明契稅計稅金額的完稅憑證等資料的，應當憑發票進行差額扣除。
根據上述規定，納稅人轉讓不動產，按照規定差額繳納增值稅的，如因丟失等原因無法提供取得不動產時的發票，可向稅務機關提供其他能證明契稅計稅金額的完稅憑證等資料，進行差額扣除。
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